Ce programme permet à l'étudiant de se former en tant que chercheur par la poursuite de recherches originales et autonomes dans les champs de recherche de la biologie végétale fondamentale et appliquée.

Au terme de ses études, l'étudiant devrait :

• avoir acquis une capacité d'analyse des résultats expérimentaux et de réflexion critique;
• être spécialiste dans un champ de recherche en biologie végétale;
• être capable d'intégrer les données relatives à son domaine de spécialisation à la biologie végétale dans son ensemble;
• être en mesure de contribuer à l'avancement des connaissances et de la pratique en biologie végétale;
• être capable de poursuivre des recherches originales de façon autonome.

L'étudiant doit s'inscrire à temps complet à ce programme et résider à l'Université durant au moins trois sessions. Cette exigence doit être satisfaite à compter de la première inscription. Les sessions d'été comptent dans le calcul du temps de résidence.

L'étudiant doit suivre les cours de son programme au cours des quatre sessions qui suivent sa première inscription. Une fois les cours suivis avec succès et au plus tard avant la fin de la cinquième session, l'étudiant doit se soumettre à un examen de doctorat ou de synthèse devant son directeur de recherche ou codirecteur et un groupe de professeurs-chercheurs (cinq au total) du programme choisis par le comité compétent.

Le programme d'études et de recherche doit être approuvé par un comité d'experts et par la direction de programme à la suite d'un exposé oral et écrit de l'étudiant à son comité d'encadrement, à la première session ou au plus tard à la fin de la deuxième session suivant la première inscription. Le comité d'experts est constitué de cinq professeurs-chercheurs, dont le directeur et le codirecteur de l'étudiant.

Thèse

La forme de présentation des résultats du travail de recherche est la thèse. On accepte habituellement l'intégration à la thèse des articles et publications scientifiques de l'étudiant. La thèse est évaluée par quatre ou cinq examinateurs (lorsqu'il y a un codirecteur) dont l'un est un spécialiste de l'extérieur. La soutenance est publique et ne peut avoir lieu qu'en présence d'au moins trois examinateurs.

Classée parmi les plus grandes facultés de recherche du Canada, la Faculté des sciences de l'agriculture et de l'alimentation reçoit annuellement quelque 20 M$ en fonds de recherche. La réputation scientifique des professeurs de la Faculté et ses liens directs avec les milieux de l'agroalimentaire, de la nutrition et de la consommation sont des gages supplémentaires de succès.

La Faculté se trouve à l'avant-plan grâce à la diversité de ses projets de recherche qui touchent les domaines suivants:

• Alimentation et répercussions sur la santé humaine
• Commerce international en agroalimentaire
• Conservation des ressources: eau, air, sol
• Distribution et transformation alimentaires
• Économie et stratégies des marchés
• Étude du comportement du consommateur
• Génie agroalimentaire
• Génomique animale et végétale
• Gestion agroalimentaire
• Innocuité et salubrité alimentaire
• Nutraceutiques et aliments fonctionnels
• Protection des espèces horticoles et physiologie
• Régie des espèces animales et végétales
• Reproduction humaine et animale
• Sciences de la consommation
• Technologies agroenvironnementales

En effectuant vos études supérieures à la Faculté, vous pourriez profiter de l'expertise de plusieurs regroupements de recherche.

Recherche en biologie végétale

Le Département de phytologie a pour mission de favoriser l'exploitation rationnelle et durable des ressources végétales par l'être humain. Il s'acquitte de cette mission en formant des professionnels compétents et en contribuant, par ses activités, de recherche, à l'avancement des sciences végétales.

Vous pourrez vous joindre à des groupes de recherche dynamiques et à l'avant-garde dans leur secteur d'activité, tels que:

• le Centre de recherche et d'innovation sur les végétaux (CRIV)
• le Groupe de recherche en écologie des tourbières (GRET)
• l'Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF)

Agroécologie
Caroline Halde, Alain Olivier

Agroforesterie
Alain Olivier

Biologie cellulaire et moléculaire végétale
Richard Bélanger, François Belzile, Dominique Michaud

Biotechnologies, génie génétique et phytogénétique
François Belzile, Jean Collin, Yves Desjardins, Charles Goulet, Dominique Michaud, Davoud Torkamaneh

Botanique fondamentale et physiologie végétale
François-P. Chalifour, Yves Desjardins, Charles Goulet, Dominique Michaud

Composés végétaux bioactifs – métabolomique et métagénomique
Yves Desjardins, Stéphanie Dudonné

Écologie, environnement et malherbologie
Chantal J. Beauchamp, Bérenger Bourgeois, Caroline Halde, Guillaume Grégoire, Yosra Menchari, Monique Poulin, Line Rochefort

Écologie et génétique microbienne
Chantal J. Beauchamp, Jean-Baptiste Leducq, Edel Pérez Lopez

Entomologie
Valérie Fournier, Edel Pérez Lopez

Phytopathologie
Richard Bélanger, Daniel Dostaler, Edel Pérez Lopez, Russell J. Tweddell

Productions végétales biologiques, durables et renouvelables
Martine Dorais, Alain Olivier, Chantal J. Beauchamp, François-P. Chalifour, Caroline Halde, Guillaume Grégoire, Line Rochefort, Nicolas Tremblay (5), Anne Vanasse

Régie des cultures fourragères, céréalières, oléoprotéagineuses et industrielles
François-P. Chalifour, Caroline Halde

Régie des cultures horticoles, ornementales, de la flore sauvage et physiologie postrécolte
Yves Desjardins, Martine Dorais, Guillaume Grégoire, Steeve Pépin, Line Rochefort

Description détaillée de l'expertise de recherche des professeurs

Chantal J. Beauchamp, professeure: Écotoxicologie des résidus et leurs impacts sur la santé des plantes, du sol et de l'eau. Écologie des microorganismes de la rhizosphère bénéfiques à la croissance des plantes. Bioluminescence. Compostage et utilisation des composts. Agriculture biologique.

Richard Bélanger, professeur: Lutte biologique des maladies des plantes en serre; écologie, mode d'action et implantation d'agents de lutte biologique. Solutions de remplacement au contrôle de l'oïdium par l'utilisation de la lutte biologique ou de la résistance induite.

François Belzile, professeur: Processus de recombinaison génétique et son exploitation dans le cadre de programmes d'amélioration génétique des espèces cultivées. Gènes qui jouent un rôle dans la correction des mésappariements de l'ADN. Programme d'amélioration génétique de l'orge et du soja par la biotechnologie comme l'haplodiploïdisation ou le développement de marqueurs moléculaires liés à des gènes de résistance.

Bérenger Bourgeois, professeur: Écologie végétale, malherbologie, agroenvironnement, résilience et multifonctionnalité des agroécosystèmes.

François-P. Chalifour, professeur: Répartition de l'azote et du carbone chez les symbioses rhizobium-légumineuses; impact des pratiques culturales sur la physiologie. Études physiologique et agronomique de la fixation de l'azote atmosphérique de symbioses rhizobium-légumineuses. 

Jean Collin, professeur: Amélioration de la résistance génétique aux maladies des céréales. Haplodiploïdisation.

Yves Desjardins, professeur: Physiologie et régie des espèces maraîchères cultivées aux champs. Régie des gazons. Métabolonique, polyphénols, petits fruits, fraises, physiologie végétale.

Martine Dorais, professeure: Physiologie et régie des espèces maraîchères cultivées en serre.

Daniel Dostaler, professeur: Maladies fongiques des plantes cultivées: épidémiologie, lutte génétique et culturale.

Stéphanie Dudonné, professeure: Caractérisation et valorisation des composés bioactifs végétaux, biodégradation microbienne, développement d'outils d'analyse métabolomique

Valérie Fournier, professeure: Écologie des insectes ravageurs, ennemis naturels et pollinisateurs. Lutte biologique aux ravageurs des cultures. Pollinisation des cultures de petits fruits, santé de l'abeille domestique et biodiversité des pollinisateurs sauvages en milieu urbain et agricole.

Charles Goulet, professeur: Biochimie et génétique de la production d'arômes chez les plantes. Étude du métabolisme secondaire.

Guillaume Grégoire, professeur: Production végétale durable, horticulture ornementale, régie des gazons résidentiels et sportifs, gestion des eaux pluviales, toits verts, biorétention.

Caroline Halde, professeure: Agriculture biologique, agroécologie, engrais verts, malherbologie, coopération internationale.

Jean-Baptiste Leducq, professeur: Écologie végétale, génomique, microbiome, phyllosphère.

Yosra Menchari, professeure: Malherbologie, lutte intégrée, phytoprotection.

Dominique Michaud, professeur: Physiologie du stress, protéolyse et moléculture végétale, à l'aide d'approches moléculaires, génomiques et protéomiques.

Alain Olivier, professeur: Agroforesterie tropicale; solutions de remplacement à la culture itinérante sur brûlis et contraintes à l'adoption de techniques agroforestières au Sahel. Au Québec, étude des cultures intercalaires avec des feuillus nobles et de la culture de plantes herbacées sous couvert forestier.

Edel Pérez Lopez, professeur: Phytopathologie, biologie moléculaire, interactions plante et agent pathogène, microbiologie, bactériologie, hernie des crucifères, biocontrôle, insectes vecteurs, phytoprotection serricole.

Steeve Pépin, professeur: Écophysiologie végétale, interactions sol-plante-atmosphère et microclimat. Réponses à court et à moyen termes des échanges gazeux (assimilation du carbone, transpiration) entre les plantes et l'atmosphère.

Monique Poulin, professeure: Écologie végétale et conservation des habitats. Facteurs influençant la diversité végétale dans les milieux humides. Structure et évolution des communautés végétales dans les milieux perturbés et restaurés. Biodiversité et restauration des bandes riveraines en milieu agricole. Aménagement et sélection de sites de conservation.

Line Rochefort, professeure: Écologie et restauration des tourbières à sphaignes; écologie, répartition et compétition chez les sphaignes. Culture de petits fruits (chicouté, bleuets, Aronia) et d'arbres sur tourbières. Biologie de la sphaigne, culture de fibres de sphaigne à grande échelle; création de fens (tourbières minérotrophiques).

Davoud Torkamaneh, professeur: Biologie computationnelle des végétaux, génomique du cannabis.

Russell J. Tweddell, professeur: Lutte intégrée contre les maladies affectant le tubercule de pomme de terre. Physiologie des champignons. Valeur nutraceutique des champignons indigènes du Québec.